Die Arbeitsgruppe für Molekulares Wirkstoffdesign (AG Wolber) beschäftigt sich mit der computergestützten Wirkstoffforschung an biologisch relevanten Zielstrukturen. Ein besonderer Schwerpunkt liegt auf dem in-silico-Design, der Modellierung und Analyse von Protein-Ligand-Interaktionen sowie auf Methoden des Virtual Screening, der Moleküldynamik und der datengetriebenen Wirkstoffoptimierung. Die entwickelten Modelle und Vorhersagen werden in enger Zusammenarbeit mit experimentellen Arbeitsgruppen validiert und für Fragestellungen der Wirkstoffentwicklung, insbesondere im Bereich von G-Protein gekoppelten Rezeptoren und weiteren pharmakologisch relevanten Targets, eingesetzt.

Die Arbeitsgruppe ist maßgeblich an der Lehre im Staatsexamensstudiengang Pharmazie sowie im Masterstudiengang Pharmazeutische Forschung beteiligt. Sie wirkt an Vorlesungen, Seminaren und Praktika mit und vermittelt insbesondere Kenntnisse in molekularer Modellierung, computergestützter Wirkstoffentwicklung und strukturbasierter Arzneistoffforschung in verschiedenen Fachsemestern.

Wir bieten Ihnen moderne Arbeitsbedingungen in einem interdisziplinär ausgerichteten Umfeld, einen unbefristeten Arbeitsplatz, eine interessante und abwechslungsreiche Tätigkeit mit hoher Eigenverantwortung, Gestaltungsspielraum und engem Austausch mit Lehrenden, Studierenden und Kooperationspartnern, ein vielfältiges Fortbildungsangebot zur umfassenden Einarbeitung sowie zur fachlichen und methodischen Weiterentwicklung, die Vereinbarkeit von Beruf und Familie durch flexible Arbeitszeitmodelle, z. B. Gleitzeit und die Möglichkeit zum mobilen Arbeiten, ein umfangreiches betriebliches Gesundheitsmanagement, 30 Tage Urlaub pro Jahr sowie zusätzlich arbeitsfrei am 24. und 31. Dezember, eine gute Verkehrsanbindung und ein bezuschusstes Firmenticket.

Nähere Infos unter https://www.bcp.fu-berlin.de/pharmazie/index.html

Wiss. Mitarbeiter*in (Praedoc) (w/m/d)

mit 65%-Teilzeitbeschäftigung

befristet bis zu 4 Jahre

Entgeltgruppe 13 TV-L FU

Kennung: Wolber_2026_2

Aufgabenbeschreibung

Aufgabengebiet:

Computergestützte Entwicklung und Optimierung niedermolekularer Modulatoren an pharmakologisch relevanten Zielstrukturen
Struktur- und ligandbasiertes Wirkstoffdesign, einschließlich Pharmakophormodellierung, Docking, virtuellem Screening sowie ML-gestützter bzw. generativer Designmethoden
Durchführung und Auswertung von Molekulardynamiksimulationen zur Analyse von Protein-Ligand-Interaktionen und dynamischen Pharmakophoren
enge Zusammenarbeit mit experimentellen Kooperationsgruppen zur Validierung und iterativen Optimierung der computergestützten Vorhersagen
Entwicklung, Dokumentation und Pflege wiederverwendbarer wissenschaftlicher Software-Workflows
Mitwirkung an der Lehre im Staatsexamensstudiengang Pharmazie sowie im Masterstudiengang
Publikation der Ergebnisse in begutachteten Fachzeitschriften und Mitwirkung bei Drittmittelanträgen
Die Stelle dient der eigenen wissenschaftlichen Qualifizierung (Promotion).

Erwartete Qualifikationen

Einstellungsvoraussetzungen: Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master, Diplom oder gleichwertiger Abschluss) in einem für das Aufgabengebiet einschlägigen Fach, z. B. Interdisciplinary Natural Sciences, Computational Sciences oder einer vergleichbaren naturwissenschaftlich orientierten Fachrichtung.

Erwünscht: Erfahrung in computergestützter Biologie, Machine Learning/Deep Learning oder datengetriebener Analyse biologischer bzw. pharmakologischer Daten. Erwartet werden gute Programmierkenntnisse, insbesondere in Python, sowie Erfahrung mit wissenschaftlichen Analyseumgebungen unter Linux/HPC. Erfahrungen mit strukturbiologischen oder pharmakologischen Fragestellungen, Protein-Ligand-Modellierung, Multi-Omics-Analysen, PK/PD-Modellierung, klinisch-pharmakologischer Datenanalyse oder der Entwicklung reproduzierbarer wissenschaftlicher Workflows.

Sehr gute Kenntnisse in maschinellem Lernen und Deep Learning, insbesondere mit PyTorch, TensorFlow/Keras, XGBoost, Autoencodern, Transfer Learning, Self-Supervised Learning, Gaussian Processes oder verwandten Verfahren.
Interesse für struktur- und ligandbasierte Wirkstoffentwicklung, insbesondere an Pharmakophormodellierung, Docking, Molekulardynamik-Simulationen, protein-ligandbezogener Strukturmodellierung und computergestützter Analyse von Interaktionsmustern
nachgewiesenes Interesse an neuropharmakologischen Wirkstoffen, GPCRs bzw. Opioidrezeptoren, funktionell selektiver Rezeptormodulation und translationaler Wirkstoffentwicklung
Erfahrung an der Schnittstelle von Pharmakologie, Chemie, Biologie und Informatik.
sehr gute schriftliche und mündliche Englischkenntnisse sowie sehr gute Deutschkenntnisse
Fähigkeit zur selbständigen wissenschaftlichen Arbeit, methodische Sorgfalt und hohe Eigeninitiative
Freude an interdisziplinärer Zusammenarbeit sowie sehr gute Kommunikationsfähigkeit.
Erfahrung in der wissenschaftlichen Präsentation und Publikation von Forschungsergebnissen
Bereitschaft zur Mitwirkung in der universitären Lehre
Zulassung zur Promotion

Hinweise zur Bewerbung

Bewerbungen sind mit aussagekräftigen Unterlagen unter Angabe der Kennung bis zum 17.08.2026 im Format PDF (vorzugsweise als ein Dokument) elektronisch per E-Mail zu richten an Herrn Prof. Dr. Gerhard Wolber: gerhard.wolber@fu-berlin.de oder per Post an die

Freie Universität Berlin Fachbereich Biologie, Chemie, Pharmazie Institut für Pharmazie Herrn Prof. Dr. Gerhard Wolber Königin-Luise-Str. 2 und 4 14195 Berlin (Dahlem)

Mit der Abgabe einer Onlinebewerbung geben Sie als Bewerber*in Ihr Einverständnis, dass Ihre Daten elektronisch verarbeitet und gespeichert werden.

Wir weisen darauf hin, dass bei ungeschützter Übersendung Ihrer Bewerbung auf elektronischem Wege von Seiten der Freien Universität Berlin keine Gewähr für die Sicherheit übermittelter persönlicher Daten übernommen werden kann.

Schwerbehinderte werden bei gleicher Qualifikation bevorzugt berücksichtigt.

Die Freie Universität Berlin fordert Frauen sowie Personen mit Migrationsgeschichte ausdrücklich zur Bewerbung auf. Vorstellungskosten können von der Freien Universität Berlin leider nicht übernommen werden.

Bewerbungsunterlagen werden nicht zurückgesandt. Bitte reichen Sie Ihre Unterlagen nur in Kopie ein.

Fakten

Veröffentlicht: 31.07.2026 Kategorie: Wissenschaftliche Mitarbeiter*in Standort: Deutschland, Berlin Aufgabengebiet: Wissenschaft & Forschung, Forschung Beginn frühestens: frühestmöglich Dauer: befristet bis zu 4 Jahre Umfang: 65%-Teilzeitbeschäftigung Vergütung: Entgeltgruppe 13 TV-L FU Arbeitssprache & erwartetes Niveau: Englisch ( sehr gute Kenntnisse ), Deutsch ( sehr gute Kenntnisse ) Homepage: https://www.fu-berlin.de/

Anforderungen

Abschluss: Master, Diplom oder gleichwertiger Abschluss Studiengang: Naturwissenschaften & Mathematik, Biologie, Biotechnologie, Mathematik

Bewerben

Bewerbungsfrist: 17.08.2026 Kennziffer: Wolber_2026_2 per Post: Freie Universität Berlin Fachbereich Biologie, Chemie, Pharmazie Institut für Pharmazie Herrn Prof. Dr. Gerhard Wolber Königin-Luise-Str. 2 und 4 14195 Berlin (Dahlem) per E-Mail: gerhard.wolber@fu-berlin.de