Constructing a prototype digital twin of animal movement in the North Sea using the European Digital Twin of the Ocean (EDITO) platform, Building and evaluating predictive models of fish movement from archived data, Building associated data visualization applications, Assessing interactions of marine fauna with offshore infrastructure, Exploring the role of digital twins for understanding animal movement, Analyzing fundamental behavioural patterns of key species such as Atlantic Cod, or Atlantic Mackerel

eigenständige Bearbeitung des Projektes „BehAIve“, Identifikation von Datenquellen und Erzeugung von Benchmarkdatensätzen zur Beschreibung kausaler Handlungssequenzen, Informationsextraktion und Disambiguierung von Alltagsaktivitäten aus heterogenen Datenquellen, Erzeugung kausaler Modelle zur Beschreibung menschlicher Alltagsaktivitäten, Evaluation der entwickelten Methoden auf Benchmarkdatensätzen, Erstellung und Präsentation von wissenschaftlichen Veröffentlichungen, Berichterstattung sowie Berichterstellung zu o. g. Tätigkeiten

Identification and evaluation of novel, heterogeneous data, Collection of relevant datasets and preprocessing for modelling, AI-supported modelling for optimized energy planning, Collaboration with project partners, Writing project reports and scientific publications (in English), Presenting project (interim) results at conferences

Analyse, Integration und Interpretation von hochdimensionalen Omics-Datensätzen im Kontext translationaler Forschungs- und Diagnostikprojekte, Bioinformatische Auswertung von bulk RNA-Sequenzierung, Single-Cell- und Single-Nucleus RNA-Seq, CITE-Seq, ATAC-Seq, NGS-basierten Datensätzen, Metabolomics- und Proteomics-Daten, Entwicklung, Erweiterung und Wartung von Analysepipelines für Omics-Daten (inkl. Qualitätskontrolle, Normalisierung, Annotation und statistischer Auswertung), Multi-Omics-Integration (z. B. Transkriptomik–Epigenomik–Metabolomik–Proteomik) zur Ableitung biologisch und klinisch relevanter Hypothesen, Enge Zusammenarbeit mit experimentellen Wissenschaftler:innen, Kliniker:innen und Diagnostiker:innen, Unterstützung bei der methodischen Implementierung bioinformatischer Workflows in translationalen und ggf. kliniknahen Kontexten, Mitwirkung bei der Erstellung wissenschaftlicher Publikationen, Drittmittelanträgen und Präsentationen

Submitting data usage requests and coordinating data handling with the data transfer management of the NAKO, Extensive data analysis and processing of results in cooperation with the project participants, Publication of results in international journals; preparation of reports; preparation of presentations within and outside the Research Training Group, Cooperation with national and international research partners, Support of the PhD training program in GRK2901/1 SYLOBIO, Preparation of research proposals

Analyse, Integration und Interpretation von hochdimensionalen Omics-Datensätzen im Kontext translationaler Forschungs- und Diagnostikprojekte, Bioinformatische Auswertung von bulk RNA-Sequenzierung, Single-Cell- und Single-Nucleus RNA-Seq, CITE-Seq, ATAC-Seq, NGS-basierten Datensätzen, Metabolomics- und Proteomics-Daten, Entwicklung, Erweiterung und Wartung von Analysepipelines für Omics-Daten (inkl. Qualitätskontrolle, Normalisierung, Annotation und statistischer Auswertung), Multi-Omics-Integration (z. B. Transkriptomik–Epigenomik–Metabolomik–Proteomik) zur Ableitung biologisch und klinisch relevanter Hypothesen, Enge Zusammenarbeit mit experimentellen Wissenschaftler:innen, Kliniker:innen und Diagnostiker:innen, Unterstützung bei der methodischen Implementierung bioinformatischer Workflows in translationalen und ggf. kliniknahen Kontexten, Mitwirkung bei der Erstellung wissenschaftlicher Publikationen, Drittmittelanträgen und Präsentationen

Conduct research in an exciting, interdisciplinary large-scale project, Analyze requirements, and contribute to the conceptualization, design, and implementation of the Fertility Data and Collaboration Hub (FeDCH), Design and implementation of the legal, data protection and data security requirements for data sharing within the CRC and beyond, Participate in the Integrated Research Training Group "Reproduction.MS PhD-Training Centre in Translational Science"

Conduct research in an exciting, interdisciplinary large-scale project, Analyze requirements, and contribute to the conceptualization, design, and implementation of the Fertility Data and Collaboration Hub (FeDCH), Design and implementation of the legal, data protection and data security requirements for data sharing within the CRC and beyond, Participate in the Integrated Research Training Group ‘Reproduction.MS PhD-Training Centre in Translational Science’

Develop, implement, and maintain bioinformatics pipelines for various omics data, including RNASeq and scSeq besides others, Contribute to the development of new algorithms and methods for the efficient analysis of large-scale omics datasets, Participate in workflow automation and management using systems such as Snakemake, Participating in the Integrated Research Training Group ‘Reproduction.MS PhD-Training Centre in Translational Science’

Development of molecular descriptors from protein structures and simulations, Design and training of QSPR and machine learning models to predict ion-exchange isotherm parametersIntegration of predicted parameters into the CADET chromatography simulation framework, Simulation and analysis of batch and gradient elution processes using predictive isotherms, Curation and analysis of experimental chromatography data for model training and validation, Collaboration with experimental and industrial partners, Dissemination of results through high-quality publications and open-source software contributions

Integrate shotgun metagenomics data with genome-scale metabolic modeling, Use machine learning methods for proposing novel strategies to increase colonization potential of engineered probiotics strains in the human gut, Contribute to national and international research projects focused on the role of the microbiome in globally significant diseases, Share knowledge through publications, conference presentations, and outreach activities

Entwicklung einer Analyse-Pipeline für räumliche Einzelzell-Transkriptomdaten (scRNA-seq), Identifikation molekularer Marker und relevanter Zelltypen im Zusammenhang mit der BRAF-Inhibitor-Resistenz von Melanom-Hirnmetastasen, Entwicklung eines netzwerkbasierten Analyseansatzes unter Einsatz maschineller Lernverfahren, Identifikation Resistenz-assoziierter Gene und zugehöriger zellulärer Regulationsprogramme, Durchführung und Auswertung komplexer bioinformatischer Datenanalysen, Bereitstellung der Analyseergebnisse als Grundlage für experimentelle Projektpartner, Enge Zusammenarbeit mit internationalen Kooperationspartnern in Greifswald, Wien, Bergen und Budapest, Integration der entwickelten Methoden und Ergebnisse in weiterführende computergestützte Forschungsarbeiten

Perform bioinformatic analyses on brain insulin resistance and the epigenetic regulation of type 2 diabetes subtypes., Develop analysis pipelines to extract deeper insights from existing epigenetic and phenotypic datasets., Analyze blood DNA methylation from a large cohort., Apply machine and deep learning methods to build an epigenetic risk score., Optimize a data-integration pipeline combining epigenetic and proteomic data into a composite score., Analyze DNA methylation in muscle biopsies., Integrate methylome and transcriptome data to predict the relationship between DNA methylation and alternative splicing., Use established clustering methods in the group (PAM and WGCNA)., Integrate clinical and epigenetic data for correlation analyses., Use machine and deep learning to derive an epigenetic risk score., Apply PAM and WGCNA for data-driven patient stratification.

Eigenverantwortliche biometrische Planung, Durchführung und Auswertung klinischer Studien nach CTR und MDR über verschiedene medizinische Fachgebiete hinweg, Einsatz und Weiterentwicklung innovativer biometrischer Methoden und statistischer Strategien zur Beantwortung komplexer klinischer Fragestellungen, Durchführung eines risikobasierten statistischen Monitorings für laufende klinische Studien, Interdisziplinäre Zusammenarbeit mit Studienzentren, Projektteams und weiteren Fachexpert:innen, Aktive Mitwirkung an der Aus- und Weiterbildung im Bereich medizinische Biometrie, Statistik und Datenmanagement, Wissensvermittlung und Qualitätssicherung durch methodische Beratung und fachliche Unterstützung innerhalb des Teams

Working with Next-Generation-Sequening (NGS) Data, Processing and analysis of metagenomic data, Working independently with different bioinformatic tools, Visualisation of the results, Validation of scientific questions for the processed data set

Conduct research on the mathematical foundations of modern data-driven learning and forecasting methods., Contribute to university teaching, including the preparation and delivery of tutorials, supervision of student projects, and grading of examinations and other coursework (1 SWS per semester)., Support and carry out research-related academic activities, such as the compilation of scientific materials, publication of research results, and participation in national and international conferences.