Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberguni-halle.de
Wissenschaftlichen Mitarbeiters*in – Datenanalyse / Bioinformatik (m-w-d)
- Location
- Halle
- Remote
- Hybrid
- Employment type
- Full-time, Temporary Work
- Experience
- Senior
- Field
- Research & Science
Requirements at a glance
- Hochschulstudium Biowissenschaften (Required)
- Promotion (Required)
- R und Python (Required)
- Mehrjährige Erfahrung NGS und Transkriptomik (Required)
- Linux (Required)
- Mehrjährige Erfahrung Krankheitsforschung (Required)
- Deutsch (Required)
- Englisch (Required)
RequiredPreferred
1 day ago
An der Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, Medizinische Fakultät, Universitätsklinik und Poliklinik für Innere Medizin I, ist ab dem nächstmöglichen Zeitpunkt die auf bis zu 3 Jahre befristete Stelle einer*eines
Wissenschaftlichen Mitarbeiters*in – Datenanalyse / Bioinformatik (m-w-d)
in Vollzeit zu besetzen. Die Vergütung erfolgt je nach Aufgabenübertragung und Erfüllung der persönlichen Voraussetzungen bis zur Entgeltgruppe 13 TV-L.
Unsere Arbeitsgruppe verfolgt das Ziel, personalisierte Prävention, Diagnose und Behandlung von Bauchspeicheldrüsenkrebs durch die Analyse von Patientenproben (Pankreas, Fettgewebe, Blut) mittels Single-Cell- und Spatial-Transcriptomics zu verbessern. Diese hochdimensionalen Analysen werden durch funktionelle Studien mit ex vivo Organoid-, Primärzell- und in vivo Mausmodellen ergänzt. Die Arbeit ist in das Pankreaszentrum Halle, das DFG-geförderte GRK2751 und das EFRE-mikroPank-Konsortium integriert. Unser Bioinformatik-Team betreut die gesamte Pipeline von der Datengenerierung bis zur klinischen Anwendung.
Arbeitsaufgaben
- Konzeption und Planung von Experimenten und Datenanalysen
- Analyse von Next Generation Sequencing (NGS)-, Einzelzellsequenzierungs (scRNA-seq / snRNA-seq) und räumlichen Transkriptomik (spatial transcriptomics) Daten
- Auswertung und Dokumentation der Forschungsergebnisse
- Schreiben von R- und / oder Python-Skripten
- Entwicklung und Optimierung von Analyse Workflows
- Etablierung neuer Daten-Analyse-Methoden
- Projektleitung
- Beteiligung an nationalen und internationalen Kooperationen
- Vorträge, Seminare
- Verfassen von begutachteten (peer reviewed) Publikationen und Anträgen
- Betreuung von Bachelor-, Master- und PhD Studierenden
- Mitwirkung an Workshops und Lehrveranstaltungen gemäß LVVO
- Möglichkeit zur eigenen wissenschaftlichen Qualifizierung ist gegeben – Habilitation
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